Terminando tareas en paralelo…

El pasado Lunes 18 de Abril, se apuntalaron y determinaron varias cosas, fundamentalmente referente a la presentación en el congreso… .

Y es que pusimos en contexto adecuado la investigación que hemos llevado a cabo y que titulábamos   “Identifying novel retrons  by bioinformatic analysis”


 

Imagen 1: Resumen de los distintos mecanismos que poseen las bacterias para su defensa frente a la infección viral (Tal and Sorek 2022, Cell 185).

Y es que el estudio de los retrones, es un punto caliente en la investigación en Microbiología en la actualidad. Y es cierto que el estudio de muchos de estos sistemas ha terminado dando lugar a herramientas muy poderosas en la Biotecnología y Biomedicina actuales (la posibilidad de trabajar con el DNA recombinante, la tecnología CRISPR, etc…).

Y como debe de quedar claro en nuestra exposición, el estudio sobre retrones arrojará luz a uno de los sistemas de defensa frente a fagos más desconocidos hasta ahora, los sistemas Abortivos (Abi). Las células de alguna manera sensan la presencia de virus y disparan todo un proceso de muerte celular que evita su replicación y la posterior infección de toda la población.

Los mecanismos de ello, parecen ser muy variados y dependen entre otras cosas del tipo de retrones del que estemos hablando:

Imagen 2: Distintos tipos de retrones clasificados según el gen efector al que parecen estar asociados

Este es el contexto en el que nos planteábamos nuestro objetivo.

 Imagen 3: Objetivo de nuestro trabajo.

Objetivo que hemos cumplido con creces y que nos permite obtener 4 conclusiones desde mi punto de vista bastante importantes:

Y por supuesto, esta presentación influye en el manuscrito que llevaremos a la Revista HSSASR. En nuestro poster que elaboraremos para el receso del congreso y vuestro trabajo para exponerlo a vuestro instituto.

Ya empezamos a estar nerviosos!!!!!

A que sí!!!!

Ya tenemos un primer título para nuestro trabajo

El pasado Viernes  08 de Abril, se tomaron decisiones importantes.

Tras comprobar y definir en detalle una nueva estructura, la del retrón correspondiente a la secuencia 1337, quedó claro que entendemos cómo se forman y porqué se propone esta estructura.

Imagen 1: Momentos de la sesión del pasado Viernes donde se aprecia el trabajo hecho por las alumnas. Han reconstruido la estructura probable del retron 1337 denominado msDNA-Pa95.

Este dibujo, resume y detalla lo que hemos entendido. Cómo se generan estas moléculas y la importancia de definir la estructura secundaria /RNA folding” de una secuencia de nucleótidos donde se infieren las famosas dos Gs: G branching y G Opposing. La primera donde se une físicamente el comienzo del cDNA y la segunda donde comienza el molde de ese cDNA.

Ahora se trata de resumir y ordenar lo que hemos aprendido/descubierto y preparar la exposición que seguro se nos dará bien.

Por el momento ya practicamos un poco lo que va a ser el próximo 5 de Mayo observando la presentación del año pasado.

Imagen 2: El video de la presentación del pasado año: que se encuentra en el blog “El DNA 4 letras muy informativas”. https://www.youtube.com/watch?v=l80QV4JLDyQ.

Y que es lo que hemos hecho?? Y por tanto que título le podemos poner de manera inicial a nuestro trabajo y en concreto para la presentación del próximo 5 de Mayo.

Creemos que el título:

“Identifying novel retrons by bioinformatic analysis”.

Refleja de manera adecuada lo que hemos hecho a lo largo de estos tres meses. Que lo podemos vislumbrar simplemente echando un vistazo a nuestro Blog.

Nos queda, terminar de realizar de forma precisa la estructura de la molécula 1337 y de entender el tamaño de todos y cada uno de los msDNAs del grupo D.

Paco ha quedado en enviarnos y que discutamos el orden y el cómo de la presentación. Lo que decidamos, influirá en:

El póster que tenemos que tener realizado para entonces.

Un primer borrador del manuscrito que formará parte del 11 volumen de la revista HSSASR.

Las primeras ideas para el trabajo de 20 páginas resumen de vuestro proyecto en el Instituto para el año que viene.

Todavía nos queda dar empaque al trabajo, pero ya estamos muy cerca. Verdad!!!!!